医局制度とは、大学医学部の付属病院においての教授を頂点とするピラミッド型の人事組織のこと。医師の配置や配置転換などは病院ではなくその医局の長である教授が人事権を握っている。医局制度の下では、大学を卒業し大学医局へ入局すると医局人事によってあちこちの関連病院へ派遣され、いわゆる「お礼奉公」が終わった後に、医局の紹介で他病院へ転職するのが一般的だった。 しかし「医師に病院を選ぶ権利がない」「不当に安く働かされる」などこの制度による弊害は兼ねてから指摘されていた。 2004年の新研修医制度導入の影響もあり、現在は廃止される方向にある。

医師の仕事は診察や手術だけではなく、診断書の作成や各種事務処理等、非常に多岐にわたる。特に診断書作成や事務処理は負担が大きく、その作業をサポートするためのスタッフが医療クラークである。具体的には診断書の作成補助、診療記録の代行入力、その他事務処理、行政への各種申請業務の代行等を行う。また看護師の補助や病院の事務処理業務等は禁止業務とされており、あくまで医師の事務サポートに特化した職種である。最近では医師の業務負担を減らすため、医療クラークを採用する病院も多い。